隔離檢疫是對來自疫區(qū)或有可能感染某種危險性疫病的植物種子、苗木、繁殖材料和活的動物,一時不易鑒定的,須在指定的隔離場地通過一段時間的裁植或飼養(yǎng)觀察、檢查,然后作出結論的檢疫。根據(jù)《中華人民共和國進出口動植物檢疫條例》第10條第2款的規(guī)定:“患有一般傳染病的動物,退回或撲殺銷毀尸體;同群動物,在動物檢疫隔離場或指定地點隔離觀察”。隔離觀察后,經(jīng)檢疫未發(fā)現(xiàn)有病的,準予進口。進出口動植物中需要進行隔離檢疫的在動物方面有:進口家畜、家禽、野生動物、蜜峰、魚、蠶等,出口的畜禽也應按有關規(guī)定,經(jīng)隔離檢疫合格后才能出口。隔離檢疫期一般30天至60天,合同中有規(guī)定的按合同規(guī)定執(zhí)行。在植物方面有:進口苗木,作繁殖材料的接穗、插穗、塊根、塊莖和種籽等,根據(jù)檢疫審批單,和進口檢疫結果,認為疑有潛伏性病害的,要經(jīng)過一定時間的隔離試種觀察。試種期限一般為植枝生長發(fā)育的一個完整周期以上,一年生植物一般為1年,多年生植物不少于2年。出口植物一般不需要作隔離檢疫。由檢疫機關認可或指定的場所隔離檢疫的植物,在隔離檢疫期間,由貨主或其代理人在檢疫機關的監(jiān)督指導下進行管理。在動植物檢疫機關的隔離場進行隔離檢疫的,經(jīng)協(xié)商,亦可由動植物檢疫機關代理;隔離檢疫期間所需要的一切費用,全由貨主承擔。在隔離檢疫中發(fā)現(xiàn)有某種危險病蟲害時,應立即作除蟲滅病或銷毀處理,被污染集裝箱、倉庫、場地、飼養(yǎng)工具等,按動植物檢疫機關的要求進行消毒處理,一切費用由貨主負擔,貨主可憑動植物檢疫機關簽發(fā)的檢疫證書向賣方提出索賠。隔離檢疫期滿,沒有發(fā)現(xiàn)任何危險病蟲害的,由檢疫機關簽發(fā)檢疫合格證書,并通知貨主,限期領回全部動植物材料。